En su informe sobre violencia, la CIDH notó que las personas intersex muchas veces experimentan violencia médica, lo que incluye las cirugías irreversibles, la esterilización involuntaria y un exceso de exámenes médicos. Producto de ello, abogó por la creación de protocolos para proteger la salud y la integridad personal de las personas intersex y la prohibición de innecesarias cirugías y esterilizaciones realizadas sin su consentimiento, entre otras medidas. En la misma línea, en su informe sobre reconocimiento, la CIDH recomendó que los Estados consideren esas intervenciones innecesarias y no consentidas como tortura.

Las nociones de igualdad y justicia están estrechamente relacionadas. Generalmente la noción de igualdad está indicada como para «todas las personas» y como si «todas las personas» fueran iguales o partieran de las mismas condiciones, aspirando a que todas las personas sean tratadas como pares. La concepción de igualdad formal ha sido el pilar del Estado de Derecho occidental, suponiendo que no debe haber un trato diferente entre aquellas personas que se encuentren bajo un mismo sistema jurídico.